由於形成過程中受到沈積環境、地質條件的影響，石灰石中會混入一些雜質，常見的包括：

矽質雜質：如石英（SiO₂）、玉髓等，矽含量過高會影響石灰石在冶金、制堿等工業中的應用（例如煉鋼時矽會增加爐渣黏度）。

黏土礦物：如高嶺石、蒙脫石等，主要成分為矽酸鹽，會降低石灰石的純度，增加煅燒時的能耗。

鐵、鋁氧化物：如氧化鐵（Fe₂O₃）、氧化鋁（Al₂O₃），少量存在時會使石灰石呈現黃、紅等顏色，過量則可能影響其在白水泥、塗料等領域的使用。

其他雜質：如硫化物（如黃鐵礦 FeS₂）、有機質等，硫化物在煅燒時會產生有害氣體，有機質則可能導致石灰石顏色偏暗。江西石灰石生產廠家